Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LUMP51884 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LUMP51884 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LUMP51884 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LUMP51884 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms