Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ERFP50548 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ERFP50548 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERFP50548 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms