Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PITPNBP48739 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms