Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGER2P43116 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGER2P43116 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms