Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PPARGP37231 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PPARGP37231 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PPARGP37231 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PPARGP37231 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms