Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DDIT3P35638 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DDIT3P35638 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms