Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASQ1P31415 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CASQ1P31415 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
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