Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
HOXA7P31268 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXA7P31268 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms