Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CD40LGP29965 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CD40LGP29965 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms