Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HTR2AP28223 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms