Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
C4BPBP20851 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
C4BPBP20851 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms