Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CD33P20138 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CD33P20138 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CD33P20138 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms