Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SPI1P17947 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SPI1P17947 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SPI1P17947 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms