Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZKSCAN1P17029 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZKSCAN1P17029 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms