Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC12.17□□□□□ -0.46
VPREB1P12018 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms