Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MS4A1P11836 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MS4A1P11836 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms