Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLUP10909 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLUP10909 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLUP10909 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLUP10909 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLUP10909 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLUP10909 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLUP10909 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLUP10909 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLUP10909 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLUP10909 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLUP10909 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLUP10909 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLUP10909 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLUP10909 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLUP10909 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLUP10909 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLUP10909 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CLUP10909 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms