Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACAA1P09110 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACAA1P09110 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms