Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYBBP04839 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYBBP04839 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYBBP04839 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CYBBP04839 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYBBP04839 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYBBP04839 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYBBP04839 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CYBBP04839 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CYBBP04839 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYBBP04839 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CYBBP04839 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CYBBP04839 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms