Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FGAP02671 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FGAP02671 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGAP02671 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FGAP02671 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FGAP02671 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FGAP02671 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FGAP02671 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGAP02671 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms