Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP19O94966 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP19O94966 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP19O94966 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
USP19O94966 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP19O94966 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
USP19O94966 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP19O94966 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP19O94966 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP19O94966 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms