Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEBLO76041 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEBLO76041 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEBLO76041 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEBLO76041 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEBLO76041 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEBLO76041 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NEBLO76041 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NEBLO76041 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NEBLO76041 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NEBLO76041 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NEBLO76041 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms