Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFNA2O43921 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms