Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRC1O43663 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRC1O43663 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRC1O43663 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRC1O43663 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PRC1O43663 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRC1O43663 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRC1O43663 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRC1O43663 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRC1O43663 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRC1O43663 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRC1O43663 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRC1O43663 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms