Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BCKDKO14874 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BCKDKO14874 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms