Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF4O00268 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF4O00268 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF4O00268 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF4O00268 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF4O00268 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF4O00268 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF4O00268 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF4O00268 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF4O00268 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4O00268 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4O00268 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4O00268 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4O00268 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4O00268 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4O00268 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TAF4O00268 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms