Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms