Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CENPBD1B2RD01 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms