Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST8SIA5-203ENST00000538168 13761 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARRDC3-201ENST00000265138 4188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CACNA1E-209ENST00000621551 14886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPDZ-202ENST00000319217 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIN-217ENST00000530997 8368 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNNM2-202ENST00000369878 15857 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms