Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HIF3AQ9Y2N7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms