Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TRAK1Q9UPV9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAK1Q9UPV9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms