Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AGAP1Q9UPQ3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms