Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRXN1Q9ULB1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms