Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TRAPPC2LQ9UL33 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC2LQ9UL33 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms