Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PACSIN3Q9UKS6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms