Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLIP2Q9UDT6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms