Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CLN8Q9UBY8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CLN8Q9UBY8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms