Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MIS18AQ9NYP9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MIS18AQ9NYP9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms