Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP4R2Q9NY27 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP4R2Q9NY27 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms