Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ASF1BQ9NVP2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ASF1BQ9NVP2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms