Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECHDC1Q9NTX5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECHDC1Q9NTX5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms