Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PKDREJQ9NTG1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PKDREJQ9NTG1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms