Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EMILIN3Q9NT22 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EMILIN3Q9NT22 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms