Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPHNQ9NQX3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPHNQ9NQX3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms