Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
MEPEQ9NQ76 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
MEPEQ9NQ76 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms