Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
POLR2J2Q9GZM3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLR2J2Q9GZM3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms