Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTR3CQ9C0K3 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTR3CQ9C0K3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms