Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UPF3BQ9BZI7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms