Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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NDUFAF3Q9BU61 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NDUFAF3Q9BU61 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NDUFAF3Q9BU61 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NDUFAF3Q9BU61 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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NDUFAF3Q9BU61 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NDUFAF3Q9BU61 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
NDUFAF3Q9BU61 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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