Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NIPSNAP3BQ9BS92 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms